期刊论文基于全基因组的金针菇光受体基因鉴定及表达分析复制

DOI: 10.13346/j.mycosystema.220245复制

文献链接: https://kns.cnki.net/kcms2/article/abstract?v=7jvqSXIa2LUCKzbSmZyt125sBozzcc__PlczCle6HII78hceqgZ-rZWmUWUxnBU2zzTCxcCJjVyljvx-SIfpwyAHYWglol_A4x4fley_IZfruQlEFKWa2QBS2bMAKIIZQH017XREcH2OBOfQsL_fsCskLUaQZsHOCPk6lXTIjjQ=&uniplatform=NZKPT复制

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基于全基因组的金针菇光受体基因鉴定及表达分析
刘建雨1李婧霆2陆欢1于海龙1宋春艳1李巧珍1张丹1徐珍1尚晓冬1王瑞娟1
1.上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部应用真菌资源与利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心2.上海海洋大学食品学院
摘要：在金针菇全基因组中鉴定到4个蓝光受体基因和1个红光受体基因。分别对5个基因的序列进行生物信息学分析，包括基因一级结构分析、保守结构分析、亚细胞定位预测以及跨膜区分析。亚细胞定位结果显示金针菇蓝光受体FfWC-1和红光受体FfPhy同时存在于细胞质和细胞核中，其他3个光受体定位于细胞质中；跨膜区分析显示5个光受体都没有跨膜区。组织表达分析FfWC-1、FfWC-2和FfCry-DASH主要在成熟菌盖中表达，FfCpl和FfPhy主要在菌丝中表达。经蓝光处理和红光处理后，5个基因的表达模式也各不相同。在金针菇基因组中未发现有VIVID基因和绿光受体基因。本结果为进一步研究金针菇乃至食用菌的光生物学特征提供了分子理论基础。
关键词： 金针菇;基因鉴定;光受体;表达分析;
基金资助： 上海市科技兴农项目[沪农科创字(2020)第1-3号]~~；
DOI： 10.13346/j.mycosystema.220245
专辑： 基础科学;农业科技
专题： 园艺
分类号： S646.15